但是，因缺乏更多证据，巫山人曾 一度受到质疑。2005年10月27日下午，黄万波教授带领的考察队第三次进驻巫山龙骨坡古人类遗址，以期发现更多证据，为巫山人是猿还是人这一问题寻找答案。考古发掘工作成果显著：发现了许多植物孢粉化石，从而推断出200万年前，龙骨坡遗址周围有森林、草地以及河流，且潮湿、温暖，适合人居住。更重要的是，考察队还发现了大量打制石器。而发现的化石有明显的石器砸削痕迹，这也证明了人类活动的存在。化石中只有动物前后腿骨，说明古人非常聪明，在外打猎无法搬动大型动物时，就将肉最多的前后腿砍下擞回洞中。大量的古人类生活遗迹足以证明,200多万年前，巫山人已经产生了文化，而文化是区别是人还是猿的重要标准。可见，巫山人是人而不是猿，而且比云南元谋人还早30万年。经过清理，专家们发现龙骨坡遗址地层剖面最上面的化石年代为180万年，最下面的为200万年，文化层跨度为20多万年。这表明巫山A在龙骨坡山洞生活了近20万年的时间。

　　2003年—2006年，中法联合考察队在龙骨坡进行了第三次发掘，除发现重要的巨猿等哺乳动物化石外，又发现了数百件以变质灰岩为主的石器。由于改变了发掘方法，考古人员获得了更多的信息，在地层剖面上揭示了23个不同时代的居住面。
　　黄万波解释道，古猿与人的区别有两点：一是形态，两者有显著差别，但是在某些方面模棱两可；二是文化，因为文化是基石。光说形态，不考虑文化的话，不可能把现代人的起源讨论清楚，因为证据不足，亦难令人信服。1960年，考古学家乔纳森在东非大裂谷发现了能人头骨，信息传出后，不少人依其形态比较，认为能人不是人而是猿。随后，他们在能人化石的同一层发现了大量石器，从而为人与猿之争画上了句号。

　　巫山县玉米洞遗址

　　40万年前巫山人用牛齿做工具
　　“玉米洞可以说是古人类的中心营地所在地。在这个超过1000平方米的山洞里，人类的足迹整整从40万年前绵延到了8000-10000年前。”三峡博物 馆副研究员、巫山县玉米洞遗址考古发掘领队贺存定说，以狩猎采集为生的古人类，以这个洞为中心，向四周探索着自然资源，他们打猎和采集完后，都会回到洞内 加工，并在这里抵御寒冷雨水。
　　考古工作者不仅发现了大量的石器骨器，还发现了在古人类遗址中比较少见的牙具，它们分别是两个用牛的牙齿做成的端刮器、一个用犀牛的牙釉质制作的刮削器。 “它们的主要作用，是肢解动物尸体和削刮木头。”考古工作者们还在8000-10000年前的地层里，发现了两个残缺的火坑，“生活在玉米洞内的古人类那 时就已经开始使用火，但这个火究竟是击打燧石而生，还是钻木取火，抑或是引来的自然火，还无法得知。”

　　巫山县大水田遗址
　　新石器时就会用黑曜石做饰品
　　大水田遗址位于巫山县曲尺乡。市文物局副局长白九江说，大水田遗址考古发掘面积共计1300平方米，发现大溪文化、商周、战国中晚期至西汉早期、六朝、唐 宋遗迹470余处，其中墓葬258座。“我们发现了五六件新石器时期用黑曜石雕刻有人、猴、野猪、穿山甲等的饰品，十分精美。”白九江说，黑曜石材质坚 硬，在当时没有金属工具的情况下，五六千年前人类能将这些图案雕刻出来，真的很不容易。

　　日期：2017-10-09 15:43:18
　　2007年，中科院古脊椎动物与人类研究所研究员黄万波教授，在巫山县官渡镇店子村小地名为“九个洞”的地方挖掘出大量古人类化石，“九个洞”因此声名远播。
　　其实“九个洞”的得名，源于附近一座高近百米的山头一块岩壁：笔直的岩壁上，分布着大大小小的洞穴，有方有圆，有高有低，当地人将此地形象地称为“九个洞”。
　　“九个洞”大小洞穴加起来一共有12个，大多呈方形，非常规整，显然不似天然形成。这些洞究竟何时有的，用来干什么的？是什么人在岩壁上挖出这一排排洞？岩壁陡峭危险，先人是如何爬上峭壁凿出的......
　　这一串串谜团，吸引着不少人前去探险揭秘。
　　2007年，当地农民刘让虎计划在山脚一个大穿洞处挖基脚建个避暑之处。雇来的几位民工往下挖到四五丈时，发现一个完整的骷髅头(包括头盖骨和面部骨头两部分)，一些迷信的村民认为挖出人骨不吉利，就将头骨砸烂后丢在了一旁。当地一位县政协干部闻听此事后前去寻找，认出是化石，便带走了仅剩的3块。
　　不久，正在巫山庙宇镇龙骨坡遗址考古的中科院古脊椎动物与人类研究所研究员、龙骨坡巫山古人类研究所所长黄万波教授闻讯，赶了过来。到现场后，黄教授便发现了一块属于两三岁小孩的、仅剩额骨的残缺人头盖骨化石，接着又找到一颗老人的门牙和一块大腿骨化石。随后，黄教授带人进行了细致的发掘工作，在此挖掘出大量老人、小孩的化石。经过初步判断，这些化石很可能是六万年的人类化石，如果此判断得到证实，那么官渡古人群有可能是现代东亚人的祖先，从而改变东亚人进化史。

　　这一惊人的消息传出，便有不少人前去探寻祖先遗迹，“九个洞”也因此而声名远播：探秘者发现，就在发掘出人类化石的大穿洞旁边笔直的岩壁上，分布着一排排方形石洞。岩洞方方正正很是规整，显然不是天然形成。当地人说，这些岩洞并非后人所为，祖祖辈辈都存在，地名也是因此而来，但究竟这些岩洞从何而来，却没人清楚。
　　高数十米的峭壁，人要上去都很难，如何能凿出方正的岩洞，又是何人因何原因在此凿洞？这些谜团吸引着更多人前来探秘。

　　日期：2017-10-09 15:51:29
　　但岩洞究竟何时有的？当地谁也说不清楚。官渡镇文化站站长龚万平和巫山县文管所易姓负责人称，其实类似位于绝壁上的方形岩洞并不只是官渡镇有，在巫山县，这样神秘的岩洞还有许多：福田镇寨子岩悬崖陡壁有二十多个岩洞，大多是四方形，大的有五十平方米，小间也有十平方米。有的有小门，有的是套间，洞顶和地面都十分平整，有的几个洞口内还可互连；抱龙镇迷宫洞有12个洞，庙宇镇七狗子洞有7个洞，龙骨坡旁边有十星洞，三溪有三眼洞，平河有五门洞……粗略统计，巫山县这样的神秘岩洞总计近百个，这些岩洞有个共同点，就是都在悬崖绝壁上，多呈方形。

　　对巫山历史颇有研究的民俗文化专家覃昌年曾就此专门进行过资料搜集，发现关于神秘岩洞的身世有几大版本：
　　说法1
　　古人栖居地
　　这种说法源于“九个洞”古人类化石的发掘。在这些神秘岩洞数米之外发现大量人类化石，有人推测，这些岩洞很可能是远古时代人类的栖居地。但黄万波教授认为，这种可能性很小，经过检测，官渡人化石应该在6000年以前，而从这些洞穴凿痕和风化程度看，应该没有这么久的时间。